Ze względu na specyfikę anatomi końskiego uzębienia, kontrole i korekcje stomatologiczne powinny być rutynowym co rocznym zabiegiem podobnie jak szczepienie. Wady zgryzu występujące u części koni zmuszają do korekcji nawet co sześć miesięcy. Zaniedbanie korekcji stomatologicznej może prowadzić do zaburzeń w jedzeniu i co za tym idzie spadku masy ciała czy kolek. U koni użytkowanych wierzchowo dodtakowym utrudnieniem jest spadek tolerancji wędzidła.
W przypadku chorób zębów przedtrzonowych i trzonowych takich jak zapalenie korzenia zęba może dojść do wtórnego zapalenia zatoki szczękowej, wówczas terapia obejmuje chory ząb i zatokę, nierzadko kończy sie na interwencji chirurgicznej i usuwaniu chorego zęba. Rzadziej mamy do czynienia z pierwotnym zapaleniem zatoki na tle bakteryjnym czy grzybiczym. Dość rzadko obserwujemy u koni występowanie guzów o charakterze nowotworowym czy wrodzonych cyst zębonośnych w świetle zatok. Zapalenie zatoki najczęściej powoduje wypływ ropny lub krwisty z jednego nozdrza często o cuchnącym zapachu. Wypływ świadczy o drożności ujścia zatoki szczękowej do światła przewodu nosowego, nie zawsze więc zmniejszenie wypływu oznacza że zapalenie zostało wyleczone. W diagnostyce chorób zatok przynosowych posługujemy się badaniem klinicznym, endoskopowym, radiologicznym.