Badanie gastroskopowe jest badaniem służącym głownie diagnostyce EGUS czyli syndromu wrzodowego żołądka koni. Koń jest zwierzęciem predysponowanym do wrzodów żołądka z uwagi na budowę żołądka, który u koni jest bardzo mały, a także zbudowany z dwóch części gdzie jedna część – bezgruczołowa, nie jest chroniona przed sokiem żołądkowym i często ulega owrzodzeniom. Dużym problemem są również owrzodzenia części gruczołowej żołądka, których przyczyna nie jest do końca poznana a leczenie przysparza wielu trudności. Choroba części gruczołowej często powoduje zmiany behawioralne, chudnięcie i posmutnienie.
Badanie jest wykonywane w stajni po odpowiednim przegłodzeniu konia i podaniu sedacji.